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t-SNE를 이용한 차원 감소 (Dimension reduction)

t-SNE를 이용한 차원 감소 조대협 (http://bcho.tistory.com) PCA 기반 차원 감소의 문제점앞의 글에서 차원 감소에 대한 개념과, 차원 감소 알고리즘의 하나인 PCA 알고리즘에 대해서 살펴보았다.PCA의 경우 선형 분석 방식으로 값을 사상하기 때문에 차원이 감소되면서 군집화 되어 있는 데이타들이 뭉게져서 제대로 구별할 수 없는 문제를 가지고 있다. 아래 그림을 보자 출처 https://www.youtube.com/watch?v=NEaUSP4YerM 이 그림은 2차원에서 1차원으로 PCA 분석을 이용하여 차원을 줄인 예인데, 2차원에서는 파란색과 붉은색이 구별이 되는데, 1차원으로 줄면서 1차원상의 위치가 유사한 바람에, 두 군집의 변별력이 없어져 버렸다.t-SNE이런 문제를 해결하..

클러스터링 #3 - DBSCAN (밀도 기반 클러스터링)

DBSCAN (밀도 기반 클러스터링) 조대협(http://bcho.tistory.com)기본 개념이번에는 클러스터링 알고리즘중 밀도 방식의 클러스터링을 사용하는 DBSCAN(Density-based spatial clustering of applications with noise) 에 대해서 알아보도록 한다.앞에서 설명한 K Means나 Hierarchical 클러스터링의 경우 군집간의 거리를 이용하여 클러스터링을 하는 방법인데, 밀도 기반의 클러스터링은 점이 세밀하게 몰려 있어서 밀도가 높은 부분을 클러스터링 하는 방식이다. 쉽게 설명하면, 어느점을 기준으로 반경 x내에 점이 n개 이상 있으면 하나의 군집으로 인식하는 방식이다. 그러면 조금 더 구체적인 개념과 용어를 이해해보자먼저 점 p가 있다고 할때..

클러스터링 #2 - Hierarchical clustering (계층 분석)

Hierarchical clustering을 이용한 데이타 군집화 조대협 (http://bcho.tistory.com) Hierarchical clustering (한글 : 계층적 군집 분석) 은 비슷한 군집끼리 묶어 가면서 최종 적으로는 하나의 케이스가 될때까지 군집을 묶는 클러스터링 알고리즘이다. 군집간의 거리를 기반으로 클러스터링을 하는 알고리즘이며, K Means와는 다르게 군집의 수를 미리 정해주지 않아도 된다. 참고로 이 글에서 사용된 예제 코드는 https://github.com/bwcho75/dataanalyticsandML/blob/master/Clustering/3.%20Hierarchical%20clustering-IRIS%204%20feature.ipynb 에 저장되어 있다. 예를 ..

파이썬을 이용한 데이타 시각화 #1 - Matplotlib 기본 그래프 그리기

파이썬을 이용한 데이타 시각화 #1 - Matplotlib 기본 그래프 그리기 조대협 (http://bcho.tistory.com) 백앤드 엔지니어와 백그라운드를 가진 경험상, 머신러닝을 공부하면서 헷갈렸던 부분중 하나가, 데이타에 대한 시각화이다. 머신러닝은 모델을 구현하는 것도 중요하지만, 학습할 데이타를 선별하고, 만들어진 모델을 검증하기 위해서는 데이타를 이해하는 것이 필수적이고 이를 위해서는 데이타를 시각화 해서 보는 것이 매우 중요하다. 그동안 그래프를 그리는 것을 스택오버플로우등에서 찾아서 복붙을 해서 사용하다가 matplotlib를 정리해야겠다고 해서 메뉴얼을 봤지만 도무지 이해가 되지 않아서, 결국 온라인 강좌를 들어서 정리해봤는데, 역시 강좌를 들으니까는 훨씬 빠르게 이해가 된다.참고한..

파이썬 전역 변수

파이썬에서 전역변수 사용하기 (2.7X 버전) 조대협 (http://bcho.tistory.com) 파이썬에서 전역 변수를 사용하려고 하니 "Unbound Local Error"가 나더라.파이썬은 로컬 변수를 자바처럼 쓸수가 없다. 잘못된 코드 global_value = 1 def myfunction(): global_value=global_value + 1 올바른 코드 global_value = 1 def myfunction(): global global_value global_value=global_value + 1 글로벌 변수로 쓰려면, 글로벌 변수를 쓰려는 곳에서 global 이라는 키워드로 선언을 해줘야 그 전역 변수를 불러다가 쓸 수 있다.

빅쿼리를 이용하여 두시간만에 트위터 실시간 데이타를 분석하는 대쉬보드 만들기

Fluentd + Bigquery + Jupyter를 이용한 초간단 BI 구축하기 조대협얼마전에 빅데이타의 전문가로 유명한 김형준님이 "Presto + Zeppelin을 이용한 초간단 BI 구축 사례"라는 발표 자료를 보았다. http://www.slideshare.net/babokim/presto-zeppelin-bi 오픈 소스 기술들을 조합하여, 초간단하게 빅데이타 분석 플랫폼을 만든 사례 인데, 상당히 실용적이기도 하고, 좋은 조합인것 같아서, 마침 구글 빅쿼리에 대한 자료를 정리하던중 비슷한 시나리오로 BI 대쉬 보드를 만들어보았다.Fluentd를 이용해서 실시간으로 데이타를 수집하고, 이를 빅쿼리에 저장한 다음에 iPython nodebook (aka Jupyter)로 대쉬보드를 만드는 예제이다..

Apache Spark-Python vs Scala 성능 비교

스파크 성능이 안나오면, 우리 회사 데이타팀 팀장왈. 먼저 파이썬으로 짰는지 확인 부터 해보라길래, 파이썬과 스칼라로 만들어진 스파크 성능 차이가 얼마나 나는지 찾아봤더니 다음과 같은 수치가 나왔다. http://emptypipes.org/2015/01/17/python-vs-scala-vs-spark/ (원본 출처) 일단 스파크를 할려면 스칼라는 필수인듯 하다. 간단한 프로토타입핑등에는 파이썬을 사용할 수 있겠지만 결국 프로적션은 스칼라로 최적화해야 할듯.근데. 자바대 스칼라 성능 비교는 없네

머신러닝 프레임웍에 대한 간단 메모

머신 러닝 프레임웍에 대한 간단 정리 머신 러닝을 다시 시작해서 보다 보니 어떤 언어로 개발을 해야 하는지 의문이 들어서 페이스북 Server Side architecture 그룹에 올렸더니, 좋은 정보가 많이 들어왔다.Matalab이나 R과 같은 언어는 수학 라이브러리가 풍부해서, 주로 모델을 만들어서 시뮬레이션 하는데 많이 사용되고Python이 수학 라이브러리가 풍부해서 그런지 ML 부분에서 많이 사용되는데, Production 까지 올라가는 경우는 잘 못본거 같고, 주로 Python으로 모델을 프로토타이핑 하는 수준으로 사용되는 것으로 보인다. 아직까지 자세히는 보지 못했지만, 자바의 Spark이나 Mahout과 같은 분산 환경 지원성이 약하고, 언어의 특성상 다른 언어보다 성능이 떨어져서, 실제 ..

Numpy Install

NumPy 설치 하기 파이썬으로 머신 러닝을 구현하기 위해서는 수학 라이브러리인 numpy가 필요하다 설치는 http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/#numpy 에서 *.whl 파일을 다운로드 받은후pip install numpy-1.9.2rc1+mkl-cp27-none-win_amd64.whl (64 비트 기준)으로 설치 하면 된다. 설치후 확인을 위해서는 위와 같이 from numpy import * 를 한후에, random.rand(4,4)가 제대로 실행되는지 확인하자 참고머신러닝이나 빅데이타 분석을 위해서는 NumPy 뿐만 아니라 matplot등 다양한 수학 모듈을 깔아야 하는데, 방화벽등이 있거나 하면 깔기가 매우 까다롭다. (의존성 관계도 복잡하고). 그래서..

Vert.x 노트

1. vert.x를 다운받아서 설치2. Python을 사용하기 위해서 Jython 을 설치- Jython 인스톨 방법은% java -jar jython_installer-2.5.2.jar 환경변수에 JYTHON_HOME을 Jython 인스톨 디렉토리로 설정 환경 준비 완료 3. 간단한 Python 테스트 ※ Company Proxy로 인하여, Vertx 모듈이 설치가 되지 않는 경우. 방법 1. Vertx는 module (라이브러리)를 외부 리포지토리로 부터 읽어와서 자동 설치 하는데,회사 proxy 등을 사용할 경우 설치가 안되며, 이를 회피하기 위한 방법도 없다. 방법은 간단한 웹서버를 로컬에 띄운후, mod.zip 파일을 그 디렉토리에 넣어야 한다.이때 주의할점은 vertx는 repository의 ..